Ugyan a hagyományos üzletek és az online áruházak között elég sok a hasonlóság, azért olyan jelentős különbségek is vannak, amelyek a papírmunkában komoly eltéréseket szülnek. A webáruház könyvelés csak nagyon kevés pontban egyezik meg egy offline cég könyvelésével, ezért olyan szakembert vagy vállalkozást kell keresni ennek megoldására, akik jártasak ezen a területen.
Például tisztában kell lenni azzal, hogy miként kell eljárni, ha saját készítésű terméket kínálunk, illetve mi az eljárás, ha csak viszonteladók vagyunk. Továbbá, akkor is különbséget kell tenni, ha Kínából vagy az USA-ból származó árucikkeket forgalmazunk, illetve egy hazai nagykereskedéssel állunk szerződésben.
Valamint a webáruház könyvelés során azt is figyelembe kell venni, ha regisztráció útján kedvezményeket, hűségpontokat lehet begyűjteni, tehát aki csak hagyományos cégekkel foglalkozik, nem biztos, hogy ezt a feladatot is meg tudja ugrani. Amennyiben profi segítséget keresünk, akkor érdemes a www.webaruhazkonyveles.hu weboldalra ellátogatni.